Affymetrix CELをparquetに変換

  1. Filestar の最新バージョンをダウンロードしてインストールします。

  2. デスクトップ上の1つ以上のCelファイルを右クリックし、Convert with Filestarを選択します。

  3. 検索ボックスにconvert to parquetと入力します。

  4. Convertを押します。

  5. AIエージェントに任せることもできます:filestarcli -i file.cel -c "convert to parquet"(方法)。

AIエージェントに「Affymetrix CELをPARQUETに変換」を任せる

Claude Code、Codex、Cursorなどのエージェントは、Filestarを使ってパソコン上でこの処理を実行できます。ファイルはパソコン内に留まります。

Filestarをインストールして、エージェントに追加してください:

npm install -g filestar
filestarcli agent install

またはワンクリックで追加:

Claude Code:

claude mcp add filestar -- npx -y [email protected] mcp

次に、エージェントに依頼してください:

“ダウンロードフォルダー内のAffymetrix CELファイルをPARQUETに変換してください”

または、ご自身で実行してください:

filestarcli -i file.cel -c "convert to parquet"

お使いのコンピューターで実行されるため、ファイルは外部に送信されません。 Windows, macOS と Linuxで動作します。 npmでインストールすると、アカウント不要で50回まで無料で変換できます。

AIエージェントで「Affymetrix CELをPARQUETに変換」はできますか?

はい。npm install -g filestarでFilestar CLIをインストールすると、エージェントがパソコン上でfilestarcli -i file.cel -c "convert to parquet"を実行できるようになります。ファイルはパソコン内に留まります。

AIエージェントでFilestarを使う →

Affymetrix CELと.parquetの違いは何ですか?

拡張子
.cel
.parquet
形式
バイナリ
バイナリ
カテゴリー
データ
データ
開発元
Affymetrix
The Apache Software Foundation
説明
Affymetrix CELファイルは、GeneChipマイクロアレイを1回スキャンした際のプローブ強度を格納します。各プローブセルのx座標とy座標、強度、標準偏差、ピクセル数を、v4バイナリGCOS形式または旧来のv3テキスト形式で保存します。遺伝子発現解析の基礎となるデータで、GEOでは通常gzip圧縮して配布されています。
Parquetファイルは、列指向のデータテーブルです。各列が型情報を持ち、圧縮された状態で個別に保存されるため、分析ツールは必要な列だけを読み取れます。データレイク、Spark、pandas、DuckDBで広く使われるデータ交換形式です。
MIMEタイプ
application/octet-stream
application/vnd.apache.parquet
サンプル
sample.parquet

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