Affymetrix CEL 파일은 GeneChip 마이크로어레이를 한 번 스캔한 프로브 강도 데이터를 담아요. 각 프로브 셀의 x 및 y 위치, 강도, 표준 편차, 픽셀 수를 v4 바이너리 GCOS 형식이나 이전 v3 텍스트 형식으로 저장해요. 유전자 발현 분석의 기초 데이터이며, GEO에서 보통 gzip으로 압축해 배포해요.
JSON Lines 파일은 한 줄에 하나의 JSON 값을 담으며, 보통 한 줄이 하나의 레코드에 해당해 스트림 형태로 읽고 쓸 수 있어요. 로그, 데이터 내보내기, 머신러닝 데이터셋에 사용돼요.