Affymetrix CEL 파일은 GeneChip 마이크로어레이를 한 번 스캔한 프로브 강도 데이터를 담아요. 각 프로브 셀의 x 및 y 위치, 강도, 표준 편차, 픽셀 수를 v4 바이너리 GCOS 형식이나 이전 v3 텍스트 형식으로 저장해요. 유전자 발현 분석의 기초 데이터이며, GEO에서 보통 gzip으로 압축해 배포해요.
JSON(JavaScript Object Notation) 파일은 데이터 교환에 사용되는 가벼운 텍스트 기반 형식으로, 사람이 읽기 쉬워요. 데이터를 저장하고 전달하도록 설계되었어요. JSON 파일은 .json 확장자를 사용하며 이름/값 쌍의 모음으로 구성돼요. 이름은 문자열이고, 값은 문자열, 숫자, 배열 또는 다른 JSON 객체일 수 있어요. 웹 애플리케이션에서 클라이언트와 서버 간에 데이터를 교환하는 데 널리 사용되며, 설정 파일에도 쓰여요.