Affymetrix CEL 파일은 GeneChip 마이크로어레이를 한 번 스캔한 프로브 강도 데이터를 담아요. 각 프로브 셀의 x 및 y 위치, 강도, 표준 편차, 픽셀 수를 v4 바이너리 GCOS 형식이나 이전 v3 텍스트 형식으로 저장해요. 유전자 발현 분석의 기초 데이터이며, GEO에서 보통 gzip으로 압축해 배포해요.
DTA 파일은 Stata 데이터 세트예요. Stata 통계 패키지에서 작성한 데이터 테이블로, 변수 이름, 유형, 표시 형식, 변수 레이블, 값 레이블이 포함되어 있어요. Zeiss BIVAS에서도 이미지 파일에 같은 확장자를 사용해요.